AIが薬候補を見つける - DeepPurposeで加速する「分子×タンパク質」スクリーニング

最近、私たちが取り組んでいる話題として、DeepPurpose というオープンソースの薬剤スクリーニング AI ツールを使った研究があります。今回はこの DeepPurpose を用いて、ロングコロナに対する自然化合物のスクリーニングを行っている背景や意義についてご紹介します。DeepPurposeとは何か？DeepPurpose は、もともとハーバード大学、ジョージア工科大学、イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校、およびIQVIAの研究者によってCOVID-19に対する薬剤候補を見つける目的で開発された、（注：一部の関連資料ではMITとの関係も指摘されていますが、公式論文ではMITの明記は確認されていません）Pythonベースの深層学習ライブラリです。薬の分子構造（SMILES 形式）と標的タンパク質のアミノ酸配列を入力として、結合予測（pIC50）を出力します。（https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/22-23/5545/6020256）しかし、2020年以降の開発は停滞しており、当初の COVID-19 向け応用も中

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