클릭 초기화를 빼먹었네. 다음과 같이 하면 돼.

        // (...omitted...)
        "initClicks": function(_options) {
            return function(e) {
                if($(this).attr("href").indexOf(":/") < 0) {
                    e.preventDefault();
                    $().App.renderTemplate($(this).attr("href"), $().App.routes, false, _options);
                }
            }
        },
        // (...omitted...)

읽어줘서 고마워 :)